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雄鸡来贺岁,中国有了GSA! ——2017年GPB第一期内容回顾

韩潇 GPBees 2023-08-18



喔喔喔~

2017年即将结束

您可还记得鸡年伊始

国内生物信息资源服务领域发生的一件大事?

跟着小G一起复习一下本期的主要内容吧!



在精准医学和海量大数据时代

时间可是不等人哒!

嗖嗖嗖嗖,眼睛一闭一睁

医学界精准医学概念提出已有六年

主编于军博士亲自撰写刊首语

述说了“精准医学”一词产生的背景

帮你更精准地了解精准医学


于老师博士后导师也大驾光临哦!

美国科学院院士

华盛顿大学基因科学与医学名誉退休教授

Maynard Olson

作为唯一一位先后参与

人类基因组计划和精准医学计划发起的科学家

以亲历者的身份

为大家讲述这两大航母级大科学计划的幕后故事~

中文全文可点击下方阅读原文查阅



当然咯,还有更兴奋的事——

中国人自己的数据库GSA横空出世咯!

众所周知,以上说到的两个计划

都产生了海量的测序和其他生物数据

作为数据产出大国中的一员

小伙伴们是否还在为论文发表前

必须将数据存到海外数据库而烦恼呢?



鸡年新机会!

这期GPB带我们走进中国人自己的基因组数据归档数据库:

GSA(Genome Sequence Archive)

聊一聊数据那些事儿~


北京大学的罗静初教授旁征博引

带领我们回顾半个世纪以来

生物学相关数据库的发展历程

并向大家隆重推介GSA和BIGD

希望能推动

我国建立国家级生物信息中心事业的发展

 

要想在大数据的浪潮中扬帆远航

建立并发展属于自己的大数据中心迫在眉睫!


中科院基因组所生命与健康大数据中心副主任

张博士曾提到:

GSA数据库将立足中国、面向全球

接收不同测序平台产生的组学原始数据

提供数据长期存储、管理与共享服务

遵循国际核酸数据库联盟(INSDC)的

数据库建设标准

为用户提供便捷、安全的预审稿链接和

超大规模数据的个性化递交服务

20余位中科院北京基因组所工作人员发文

介绍并力荐中国人自己的数据库GSA


怎么样?有了GSA,

老板再也不用担心我的测序数据提交了~

这两篇文章的中文全文亦可点击下方阅读原文查阅



来来来,更多精彩内容,不要走开~


在胚胎时期

大脑中赖氨酸乙酰化和脱乙酰化

参与了大脑发育的各个过程

对于长大后大脑的维持和功能

可是有着至关重要的影响!

本期德国编委汪兆琦博士等人

对参与这个过程的重要修饰酶做了很系统的介绍

总结了赖氨酸(脱)乙酰化功能失调相关的

神经发育障碍疾病~

让你离神奇的胚胎发育更进一步

 

除此之外

针对慢性骨髓增生性疾病——

原发性骨髓纤维化(PMF)

本期文章另辟蹊径

副主编方向东博士等以一对同卵双胞胎为例

深入挖掘了PMF相关的重要基因和生物通路

(我们只是普通的双胞胎,路过,路过~)


还有还有!

澳洲的“颜值担当”

特有观花植物--胡克班克木

转录组从头拼接也闪闪亮相啦!



是不是有些迫不及待了呢

那就快快走进我们本期的GPB

一起欣赏吧!



Editorial

A Piece of History that Cannot Be Missed for Precision Medicine

Jun Yu(中科院北京基因组所,于军)

Historical Note

A Behind-the-Scenes Story of Precision Medicine

Maynard V. Olson(美国华盛顿大学基因科学与医学名誉退休教授)

Preview

GSA and BIGD: Filling the Gap of Bioinformatics Resource and Service in China

Jingchu Luo(北京大学,罗静初)

Database

GSA: Genome Sequence Archive

Yanqing Wang, Fuhai Song, Junwei Zhu, Sisi Zhang, Yadong Yang, Tingting Chen, Bixia Tang, Lili Dong, Nan Ding, Qian Zhang, Zhouxian Bai, Xunong Dong, Huanxin Chen, Mingyuan Sun, Shuang Zhai, Yubin Sun, Lei Yu, Li Lan, Jingfa Xiao, Xiangdong Fang, Hongxing Lei, Zhang Zhang, Wenming Zhao(中科院北京基因组所,方向东、雷红星、章张、赵文明)

Review

Lysine Acetylation and Deacetylation in Brain Development and Neuropathies

Alicia Tapias, Zhao-Qi Wang(德国莱布尼茨老年研究所–弗里茨李普曼所,汪兆琦)

Original Research

Transcriptome Analysis of Monozygotic Twin Brothers with Childhood Primary Myelofibrosis

Nan Ding, Zhaojun Zhang, Wenyu Yang, Lan Ren, Yingchi Zhang, Jingliao Zhang, Zhanqi Li, Peihong Zhang, Xiaofan Zhu, Xiaojuan Chen, Xiangdong Fang(中科院北京基因组所,方向东)

Letter

Characterization of Leaf Transcriptome in Banksia hookeriana

Sim Lin Lim, Haylee M. D’Agui, Neal J. Enright, Tianhua He(澳大利亚科廷大学)


详情请 登陆

http://gpb.big.ac.cn/(也可点击下方阅读全文)


Genomics,Proteomics & Bioinformatics(基因组蛋白质组与生物信息学报,简称GPB):创刊于2003年,是由中国科学院主管,中科院北京基因组所与中国遗传学会共同主办的英文版核心期刊。目前GPB为双月刊,由Elsevier以开放获取(Open Access)的模式出版,刊载来自世界范围内组学、生物信息学及相关领域的优质稿件。2017年被SCIE、JCR和CSTPCD数据库收录,连续五年(2013–2017)获得“中国最具国际影响力学术期刊”称号,连续两期获得“中国科技期刊国际影响力提升计划”项目资助(2013–2018)。

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